Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab23P35288 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab23P35288 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms