Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms