Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp4P35123 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms