Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc1P34928 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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