Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptk2P34152 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms