Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms