Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms