Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc10P31257 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms