Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms