Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms