Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprmP28828 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprmP28828 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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