Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms