Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BgnP28653 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BgnP28653 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BgnP28653 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BgnP28653 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BgnP28653 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BgnP28653 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BgnP28653 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BgnP28653 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms