Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BrafP28028 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BrafP28028 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BrafP28028 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BrafP28028 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BrafP28028 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BrafP28028 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BrafP28028 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms