Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CftrP26361 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CftrP26361 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CftrP26361 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CftrP26361 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CftrP26361 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CftrP26361 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CftrP26361 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CftrP26361 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CftrP26361 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CftrP26361 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CftrP26361 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CftrP26361 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CftrP26361 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms