Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms