Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms