Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LynP25911 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LynP25911 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LynP25911 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LynP25911 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms