Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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