Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms