Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PparaP23204 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PparaP23204 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PparaP23204 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms