Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcb1aP21447 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms