Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prim1P20664 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms