Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TP20293 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TP20293 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TP20293 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TP20293 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TP20293 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms