Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P20040 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P20040 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P20040 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P20040 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P20040 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P20040 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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