Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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