Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn1P18608 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms