Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcnaP17918 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms