Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa-rs1P17533 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa-rs1P17533 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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