Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms