Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms