Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SptbP15508 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptbP15508 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptbP15508 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SptbP15508 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms