Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms