Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrphP15331 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrphP15331 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrphP15331 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrphP15331 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms