Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-D1P14427 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms