Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms