Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms