Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga5P11688 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga5P11688 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms