Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DmdP11531 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DmdP11531 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DmdP11531 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DmdP11531 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms