Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms