Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp28P10078 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms