Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb2P0C1T1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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