Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa9P09631 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms