Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06321 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06321 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06321 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06321 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06321 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06321 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms