Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MbP04247 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MbP04247 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MbP04247 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MbP04247 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MbP04247 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MbP04247 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms