Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04212 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04212 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04212 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04212 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04212 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04212 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04212 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04212 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms