Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgfb1P04202 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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