Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tk1P04184 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tk1P04184 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms