Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt1P04104 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms