Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3f3cP02301 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H3f3cP02301 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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